未登記工廠遍佈農地，至今數量仍不斷成長，政府的輔導與補辦臨時登記期程卻不斷展延，更為此要將部分特定農業區土地變更為一般農業區，也等於可作為丁種建築用地。
在22日營建署第382次區委會中，嘉義縣與彰化縣合計提出19筆土地變更案，雖然多位區委對此感到不滿砲聲隆隆，但縣市政府左一句「歷史共業」右一句「行政院既定政策」，也讓此案難以挽回。
第382次區委會，彰化、嘉義兩縣為解決違章工廠，提出多處特農變更為一般農。攝影：賴品瑀。
而此次會議嘉義縣送10件，位於太保市後潭段、彰化縣送9件，位在鹿港鎮與福興鄉，其中彰化縣長魏明谷更親自到場。最後僅彰化3件範圍內有工廠尚未取得臨時工廠登記者先保留，其餘宣告過關。
對於特定農業區改一般農業區，再變更為一般工廠用地，各縣市積極送審。圖片來源：翻攝營建署簡報資料。
彰化縣稱送審案為「違章優等生」 區委、環團不買單
魏明谷表示，彰化縣是全台土地最小的縣，卻住了130萬人口，同時為農業、工業大縣，也擁有了1.2萬家合法工廠、8千家的違章工廠。雖然他在競選時就高談「彰北工、彰南農」的願景，但實際上任後，卻面對縣議會每年只給100萬的經費去拆除違章工廠，等於要22年才能拆完境內的所有違章工廠。反觀這些工廠，有些已經做了60年、傳三代，這樣的「歷史共業」也是要中央與縣市一起面對。魏明谷坦言，由於彰化的農地價格遠低於台中，違章工廠一直在增加，目前彰化每年流失了30公頃的農地。
彰化縣提出三產業核心，分別為彰北產業核心，包含了彰化市、和美、秀水、鹿港與彰濱，將把優勢產業優先往此集中，二林產業核心，包括二林與西湖，主要發展精密機械，高鐵新興產業核心則是花卉、綠色科技為主。
彰縣府強調，此次送審的變更案，當中的業者都已是違章工廠裡面的「優等生」，其餘更零星的、屬產業邊緣的，往往有為了求生而有污染環境求利的狀況，對這種業者，縣府則以不斷稽查開罰的方式，要讓他們的成本因此提高，最後在市場中遭到淘汰。
全國區域計畫中未登記工廠的處理途徑。圖片來源：翻攝營建署簡報資料。
但這樣的作法，並未獲得區委的認同，政大地政系教授戴秀雄便質疑，這些獲利狀況好、已具規模的，也是其中較有能力遷往工業區的違章工廠，但政府選擇拆小的、讓大的就地合法，這樣並不公平， 也恐形成「破窗效應」，將來更多業者會問「為何大家都能我不能？」
地球公民基金會研究員潘正正也指出，以之前蔡英文競選中曾去參觀的鹿港頂番婆地區水五金產業中的「帝寶」為例，指出全球的頂級車燈幾乎皆其製造，當然有財力遷往工業區。
戴秀雄更打臉彰縣府，指出1980年曾經有過一次違章工廠納編，因此根本不會有所謂「作了三代、經營了60年的」違章工廠，而這些1980年以後才成立的違章工廠又怎可就地合法？
立院還要修法再放寬工廠登記 區委籲優良農地才該優先
在此次審查，彰化縣有3處因區域有工廠未取得臨時工廠登記而暫遭保留。而取得臨登的條件則有必須在2008年前設立、且認定為低污染。但事實上，目前《工廠管理輔導法》正在修法，藍綠皆有委員提出版本，也都已經一讀，兩版本皆是提出修改第33、34兩條，再次放寬工廠登記申請限制及展延登記受理期限等。
面對不能說不的場面，營建署表示，要求縣市政府要提出整體產業空間發展構想，以避免零星個案審查，也要求縣市政府說明這些特農轉一般農後，將對農地總量影響的情形，並提出因應對策，更要詳細說明相關配套，如何讓違章工廠規模不再擴大的決心。
但海洋大學河海工程學系教授蕭再安指出，農委會算出全台必須保留74萬公頃的土地作為農地，其算法是這樣的面積全種植稻米與甘薯等「提供熱量」糧食來養活全台人口，並不包括蔬果等，因此這個74萬應該是下限，目前經濟部與縣市政府將其視為上限的思維並不正確。成功大學環工系教授林素貞也認為應該翻轉觀念，優良農地應該是最優先保留的，不該再推給歷史共業，也不該再讓這些違章工廠化零為整。